阿拉杰里綜合癥（Alagille Syndrome, ALGS）, 又稱Alagille-Watson 綜合癥或肝動脈發(fā)育異常，是由JAG1或NOTCH2基因突變引發(fā)的一種累積多系統(tǒng)的常染色體顯性遺傳病。患者肝臟癥狀有劇烈瘙癢，黃疸，皮膚黃瘤，尿液顏色加深，白陶土樣大便等；心臟癥狀有長時間活動容易疲乏、呼吸急促、甚至昏厥等；面部特征有前額寬闊、眼窩深陷、尖下巴等；眼睛特征有角膜后胚胎環(huán)；身材矮小等。據(jù)統(tǒng)計(jì)，僅有~ 40%的患者是從父母那里遺傳得到突變基因而患?。粇 60%患者是新發(fā)突變致病。已知拷貝數(shù)變異（copy number variants, CNVs）和結(jié)構(gòu)變異（structural variants, SVs）也是ALGS常見致病原因。本研究借助OGM技術(shù)，明確了一例ALGS患者的分子診斷。

1光學(xué)基因組圖譜（optical genome mapping, OGM）：從先證者外周血中抽提 >150 kb長度的基因組DNA, 經(jīng)特殊位點(diǎn)熒光標(biāo)記-單分子電泳-成像-信息轉(zhuǎn)換（圖像到分子）-基因組從頭組裝-SV calling流程獲得結(jié)構(gòu)變異數(shù)據(jù)。

2 結(jié)構(gòu)變異分析解讀：根據(jù)變異置信度、變異的人群頻率、與表型的相關(guān)性等找到致病變異。

3 Long-range PCR和二代測序, 用以明確變異斷點(diǎn)在染色體上的位置。

4 Sanger測序，進(jìn)一步確認(rèn)斷點(diǎn)和變異來源。

5 WGS數(shù)據(jù)重分析。

6 核型分析再驗(yàn)證。

OGM在一例ALGS患者基因組中發(fā)現(xiàn)4號和20號染色體上存在一個平衡易位。該易位經(jīng)WGS原始數(shù)據(jù)重分析和核型分析均得到證實(shí)。易位在20號染色體上的斷點(diǎn)位置為chr20:10,671,496 (參考基因組hg38), 導(dǎo)致20號染色體上殘存JAG1基因的1號和2號外顯子與4號染色體上易位來的FAM13A基因7號內(nèi)含子反向序列融合表達(dá)，產(chǎn)生提前終止密碼子。該變異是新發(fā)變異。

https://www.hindawi.com/journals/humu/2023/5396281/（復(fù)制鏈接網(wǎng)頁打開）

光學(xué)基因組圖譜技術(shù)（optical genome mapping, OGM）是一種新型高分辨率細(xì)胞遺傳學(xué)分析技術(shù)，該技術(shù)可以利用單個DNA分子基因組限制性內(nèi)切酶圖譜快速生成高分辨率、有序的全基因組限制性內(nèi)切酶圖譜，在檢測基因組結(jié)構(gòu)變異的方面具有重大應(yīng)用價值；這一技術(shù)進(jìn)而可以與現(xiàn)有的高通量測序技術(shù)（next generation sequencing, NGS）相結(jié)合，優(yōu)化涉及遺傳病、腫瘤、血液病等多個領(lǐng)域的檢測流程。

韋翰斯面向各類教育研究和醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供遺傳病方向的科研合作，包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀遺傳學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)四大方向。

在了解到客戶的實(shí)際需求后，我們經(jīng)驗(yàn)豐富的管理人員會對項(xiàng)目的需求進(jìn)行采集和評估，著手制定方案或給出方案建議，還會根據(jù)客戶需要進(jìn)行技術(shù)咨詢；完成協(xié)商、簽署合同之后，韋翰斯強(qiáng)大的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)會按照合同約定保質(zhì)保量地完成項(xiàng)目，并且發(fā)送包括質(zhì)檢報(bào)告、中期報(bào)告和結(jié)題報(bào)告在內(nèi)的相關(guān)結(jié)果，然后再根據(jù)客戶反饋來妥善安排售后服務(wù)。