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miRNA測(cè)序分析

產(chǎn)品簡(jiǎn)介

RNA(small RNA)是存在于生物體內(nèi)的一類高度保守的RNA,序列的長(zhǎng)度一般在18-32nt之間,小RNA包括了微小RNA(microRNA, miRNA),小干擾RNA(siRNA),核仁小RNA(snoRNA)和piRNA等。MicroRNA通過(guò)與mRNA相互作用影響目標(biāo)mRNA的穩(wěn)定性及翻譯,最終誘導(dǎo)基因沉默,調(diào)控基因表達(dá)、細(xì)胞生長(zhǎng)、發(fā)育等生物學(xué)過(guò)程。對(duì)Small RNA 的測(cè)序分析可以得到物種全基因組水平的Small RNA 圖譜,挖掘新Small RNA 分子、預(yù)測(cè)靶基因、樣品間差異表達(dá)分析、聚類分析等應(yīng)用。

韋翰斯生物通過(guò)富集樣本中所有的特定長(zhǎng)度的小RNA片段進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量,一次性可以獲得數(shù)百萬(wàn)條小RNA的序列信息,并依托后續(xù)強(qiáng)大的生物信息分析平臺(tái),可以實(shí)現(xiàn)小RNA的各類信息分析,鑒定已知或探索未知小RNA與其靶作用基因以及解析各類小RNA之間或與mRNA的互作關(guān)系等。


技術(shù)路線


數(shù)據(jù)分析

lncRNA分析內(nèi)容

基本分析

高級(jí)分析

原始數(shù)據(jù)質(zhì)控及評(píng)估

與mRNA關(guān)聯(lián)分析(需有mRNA數(shù)據(jù))

與miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析

與lncRNA關(guān)聯(lián)分析(需有l(wèi)ncRNA數(shù)據(jù))

小RNA分類及注釋

miRNA靶基因預(yù)測(cè)

差異表達(dá)分析

個(gè)性化分析

案例展示

Plasma MicroRNA Pair Panels as Novel Biomarkers for Detection of Early Stage Breast Cancer

血漿microRNA對(duì)可作為早期乳腺癌檢測(cè)的新標(biāo)志物

乳腺癌是影響女性健康的重要疾病,早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療是提高療效的關(guān)鍵。但目前的標(biāo)志物假陽(yáng)性率比較高,靈敏度較低。

研究人員對(duì)乳腺癌患者、良性病變者、正常人進(jìn)行microRNA測(cè)序,對(duì)其中13個(gè)差異表達(dá)microRNA進(jìn)行qPCR驗(yàn)證,通過(guò)構(gòu)建篩查模型證實(shí)了5個(gè)pairs可作為早期診斷標(biāo)記物。


Fang R , Zhu Y , Hu L , et al. Plasma MicroRNA Pair Panels as Novel Biomarkers for Detection of Early Stage Breast Cancer[J]. Frontiers in Physiology, 2019, 9.



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